应用场景
转录因子鉴定:筛选及验证调控特定启动子、增强子、沉默子的新型或已知转录因子
互作复合物研究:解析复杂基因组区域(如癌基因调控区)招募的多蛋白复合物组成(如TF共激活/共抑制复合体)
表观遗传机制:探索DNA结合蛋白与组蛋白修饰酶(如甲基化酶/去甲基化酶)的协同作用
调控元件功能验证:深度验证ChIP-seq、ATAC-seq等揭示的潜在功能性调控元件
药物靶点研究:鉴定结合致癌/疾病相关DNA元件的蛋白作为治疗干预靶点
技术优势
直接互作验证:明确DNA序列与蛋白的直接结合能力,排除染色质高级结构干扰
高灵敏度与特异性:生物素-链霉亲和素系统结合严格洗涤,背景噪音低
灵活可控的探针设计:自由设计突变体/截断体DNA,精确定位结合关键序列(如转录因子响应元件)
兼容高通量筛选:结合质谱可一次性鉴定数十种未知结合蛋白,加速转录调控网络绘制