DNA甲基化是表观遗传调控的核心机制之一，广泛参与基因表达调控、基因组稳定性维持以及细胞分化等生物学过程。WGBS（Whole Genome Bisulfite Sequencing） 和 RRBS（Reduced Representation Bisulfite Sequencing） 是两种主流的非定向DNA甲基化检测技术，分别适用于不同研究需求。
WGBS采用亚硫酸盐处理+全基因组测序，提供单碱基分辨率的甲基化图谱，覆盖全基因组 ≥85%的CpG位点，是甲基化研究的黄金标准，适用于高精度表观遗传学研究。测序数据量大，内容全面，深度30X。
RRBS 通过富集CpG岛区域，更着重检测了甲基化发生更活跃的区域。相比WGBS而言，在保证CpG密集区域（如启动子、增强子）高覆盖度的同时，显著降低测序数据量，具有更高性价比，适合大样本队列研究。
服务流程
WGBS：样本制备 → DNA提取与质检 → 亚硫酸盐处理 → 文库构建 → 高通量测序 → 数据质控 → 甲基化位点识别 → 差异甲基化区域分析 → 功能注释 → 报告交付
RRBS：样本制备 → DNA提取与质检 → MspI酶切 → 片段选择 → 亚硫酸盐处理 → 文库构建 → 高通量测序 → 数据质控 → 甲基化分析 → 差异甲基化区域检测 → 报告交付
应用场景
DNA甲基化异常与 疾病发生、发育调控、环境响应 等过程密切相关。
肿瘤表观遗传学：
筛选癌症特异性甲基化标志物、发现肿瘤特有甲基化基因，解析造成甲基化驱动基因及其作用机制（如抑癌基因启动子高甲基化导致的沉默）
发育与干细胞研究：
追踪胚胎发育过程中重要基因（如印记基因）甲基化重编程的动态变化，联合下游表征类研究确定其产生的结果与发育情况的关联
农学与环境学：
鉴定作物胁迫响应相关甲基化位点的变化，或比较物种间保守甲基化模式的区别；评估污染物对甲基化谱的影响
技术优势
高精度：单碱基分辨率，精准识别甲基化位点
灵活选择：WGBS适合探索性研究，RRBS适合大样本验证
多组学整合：支持甲基化结果与 RNA-Seq、ChIP-Seq 数据联合分析（常见如甲基化-表达关联分析）