ATAC-Seq

技术服务

NEORABIO

技术服务

通过基因工程手段定向设计和生产生物分子的技术
ATAC-Seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)基于工程化Tn5转座酶,能够特异性切割并标记开放染色质区域,结合二代测序(Illumina NovaSeq/真迈平台)实现高分辨率、高灵敏度的染色质可及性检测,范围覆盖全基因组,揭示基因调控元件(如启动子、增强子)的动态变化。

服务流程

细胞悬液制备→ Tn5转座酶反应→ DNA纯化→ PCR扩增与建库→ 文库质检→ 上机测序→数据质控→ 生信分析

应用场景


肿瘤异质性研究:解析癌细胞染色质开放状态与其发生发展情况、耐药性的关系(如通过检测PD-L1调控区开放度,预测免疫治疗响应)
发育生物学:追踪胚胎干细胞分化过程中增强子动态激活,寻找结合位点
神经科学领域疾病,比较阿尔茨海默病患者与健康人神经元的染色质可及性差异,研究早期诊断方案及治疗途径

技术优势


高灵敏度:需要细胞量低,适合稀有样本(如循环肿瘤细胞)
多组学整合:支持与 RNA-Seq、ChIP-Seq 数据联合分析(如开放染色质+基因表达关联),进一步可与单细胞层面scATAC-Seq关联,解析亚细胞群特异性调控

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