全转录组测序

技术服务

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技术服务

通过基因工程手段定向设计和生产生物分子的技术
全转录组测序基于去rRNA建库技术,同步检测 mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA 等多种RNA类型,辅有单独富集circRNA策略,对不同RNA类别进行分别建库检测,测序深度高,分析内容全面。通过包含ceRNA网络构建、融合基因预测(STAR-Fusion)在内的多种进一步分析,可提供表达谱分析、融合基因检测、可变剪接事件等全方位研究。适用于多组学关联分析、复杂调控机制解析,如肿瘤微环境、植物逆境响应等。

服务流程

样本制备 → RNA提取与质检 → rRNA去除或PolyA富集 → 链特异性文库构建 → 高通量测序 → 数据质控 → RNA分类(mRNA/lncRNA/circRNA)鉴定 → 差异表达分析 → 常规功能分析 → 功能预测 → 报告交付

应用场景


多组学整合研究:
联合甲基化(WGBS)、蛋白组(质谱) 数据,解析表观-转录-蛋白调控轴。例:整合全转录组+m6A甲基化(MeRIP-Seq) 数据,揭示RNA修饰如何调控剪接。
复杂疾病机制:
如阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)的 circRNA-miRNA-mRNA 网络研究:分析患者的脑组织或外泌RNA,探索非编码RNA在tau蛋白异常沉积中的调控作用。
肿瘤发展、分型与精准治疗:
通过全转录组分析癌症vs.癌旁/正常组织,鉴定肿瘤的驱动基因(如融合基因、可变剪接事件)、免疫微环境特征(如PD-L1表达)和不同分型的耐药机制,探索肿瘤分型间分子机制的改变与特点。
农业与植物科学研究:
作物抗逆性或果实发育与品质改良方面,如:比较番茄不同成熟期的转录组,鉴定调控糖分积累的 circRNA-miRNA-mRNA轴。

技术优势


全面性:单次实验覆盖所有RNA类型,避免分批检测的批次效应。
高灵敏度:不同类型RNA分开建库,数据量充足,可检测低丰度转录本
临床转化潜力:已用于无创产前诊断(NIPT)、肿瘤液体活检等场景

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