分子对接是一种计算模拟方法，用于预测配体与靶标蛋白之间的相互作用模式。Neorabio提供的分子对接服务能够模拟药物分子或先导化合物与蛋白质靶标的结合过程，预测其结合模式和结合亲和力。通过多次对接和精细优化，确保对接结果的准确性，并且以多角度的维度进行交付，方便客户后续展示。这项技术广泛应用于药物筛选、分子机制研究以及先导化合物优化等领域，助力药物研发和分子生物学研究。
服务流程
[提交结构] → [结构预处理] → [参数设置] → [对接运行] → [结果分析] → [报告交付]
应用场景
先导化合物筛选：基于目标蛋白结构，通过高通量对接筛选潜在活性分子，为体外实验提供候选化合物
作用机制研究：分析小分子与靶点的结合模式，辅助阐明抑制机制、激活机制或变构调控机制
靶点验证与确认：结合组学发现的潜在靶点，预测配体结合能力，评估靶点是否具备成药性
化合物结构优化：基于结合构象分析，为活性分子结构修饰提供优化方向
共价抑制剂设计：模拟共价结合位点与反应机制，辅助开发具有靶向特异性的共价分子
配体比对与虚拟筛选前处理：为药效团模型构建、打分函数校准等后续计算任务提供支持
技术优势
支持多种对接平台和算法，包括AutoDock、AutoDock Vina、Glide、Gold等，满足不同精度和效率需求
具备蛋白结构预处理、口袋识别、构象采样等全流程建模能力，可应对低质量或预测结构
可结合共价对接、柔性对接、多位点对接等策略，适配不同靶点特性
配套药效团建模、虚拟筛选、结合能计算等后续服务，实现从发现到优化的一站式对接分析
支持定制化服务方案，科研/产业项目均可灵活对接，提供可视化结果与完整分析报告
拥有经验丰富的计算团队与生物背景支撑，帮助客户理解结果、指导实验验证
项目主要结果展示
•评分函数：对接结果通过评分函数进行评价，评分函数通常基于结合能、相互作用力等因素。常
见的评分函数包括静电相互作用、疏水相互作用、氢键和范德华力等。
•筛选标准：根据评分结果选择可能性较高的结合模式，评分高的结合模式通常意味着更强的结合 力和更好的稳定性。
•筛选标准：根据评分结果选择可能性较高的结合模式，评分高的结合模式通常意味着更强的结合 力和更好的稳定性。
分子对接3D结合表面图
分子对接3D相互作用图
交付内容
分子对接亲和力打分；分子对接相互作用分析；不同模型的相互作用图
交付内容